Johannes Gartner sollte schon 1997 Abt von Seckau werden - die Mönche hatten sich auf ihn geeinigt. Doch damals lehnte Gartner ab, woraufhin Pater Severin Schneider das Kloster drei Jahre lang als Prior-Administrator führte. Im zweiten Anlauf gelang es dann: Am 26. Juni 2000 wurde Johannes Gartner wieder zum Abt gewählt und nahm die Wahl daraufhin an. Zehn Jahre lang führte er das Kloster mit der für ihn typischen herzlichen und menschenfreundlichen Art, die ihn auch bei der einheimischen Bevölkerung sehr beliebt machte.