Seit dem Ende seiner politischen Karriere ist Alfred Gusenbauer als Berater (2009 für die Hypo Alpe Adria) und Lobbyist tätig. Daneben bekleidet er diverse Positionen in der Bau-, Immobilien- und Finanzbranche.
Seit dem heurigen Sommer ist Gusenbauer auch Berater der Schweizer Stadler Rail, die Schienenfahrzeuge produziert. Gusenbauer hat die Kooperation mit Peter Spuhler, CEO und Haupteigentümer von Stadler, bereits bestätigt. Der Milliardär Spuhler war Abgeordneter der konservativen Schweizerischen Volkspartei (SVP).
Stadler Rail stellt das rollende Material für die mehrheitlich private Westbahn, bei dessen Mehrheitseigentümer Hans Peter Haselsteiner Gusenbauer in mehreren Positionen tätig ist: Aufsichtsratschef des Baukonzerns Strabag, Vorsitzender der Haselsteiner Familienstiftung und Beirat in der Signa Immobiliengruppe. Gusenbauers neue Funktion beim Siemens-Konkurrenten könnte bei der Beschaffung neuer ÖBB-Nahverkehrszüge eine Rolle spielen. Trotz eines Rahmenvertrags mit Siemens habe der frühere ÖBB-Chef und nunmehrige Bundeskanzler sowie SPÖ-Chef Christian Kern den Auftrag ausgeschrieben. Gusenbauer und Kern wird ein gutes Verhältnis nachgesagt.
Seit Sommer 2009 ist Gusenbauer in beratender Funktion als Osteuropa-Experte für die WAZ-Mediengruppe tätig.
Von 2009 bis 2010 saß Gusenbauer im Aufsichtsrat der Alpine Holding GmbH, im Juli 2010 übernahm er den Aufsichtsratsvorsitz des Konkurrenzunternehmens, des Baukonzerns Strabag. Im Herbst 2009 übernahm Gusenbauer einen Posten als Europa-Direktor des chilenischen Investmentfonds Equitas European Funds. 2010 wurde er außerdem in das Board of Directors des kanadischen Bergbaukonzerns Gabriel Resources berufen, eines Unternehmens, dass zu 80 Prozent an dem umstrittenen Rosia Montana Gold-Projekt in Rumänien beteiligt ist.
Seit Kasachstan Anfang 2010 den OSZE-Vorsitz übernommen hat, berät Gusenbauer den kasachischen Präsidenten Nursultan Nasarbajew.
Im Frühjahr 2011 machte der Immobilienunternehmer Axel Mader seinen langjährigen Freund Gusenbauer zum vorsitzenden Stiftungsvorstand der Wartenfels Privatstiftung.
Seit ist Gusenbauer Miteigentümer der Cudos Advisors GmbH, eines Unternehmens, über das Investitionskapital aufgebracht werden soll.
Gusenbauer stammt aus einer Bauarbeiterfamilie aus Niederösterreich. Sein Vater Oswald war bei den Österreichischen Donaukraftwerken angestellt, seine Mutter Gertrude war unter anderem als Reinigungskraft tätig.